Nyckelskillnad - Reparation av bas excision vs Nucleotide Excision Repair
DNA utsätts ofta för skador på grund av olika interna och externa faktorer. Men mobilreparationssystem korrigerar omedelbart och ständigt skadorna innan de blir mutationer eller innan de överförs till efterföljande generationer. Det finns tre typer av excisionsreparationssystem i cellerna: Nucleotide excision repair (NER), base excision repair (BER) och DNA mismatch repair (MMR) för att reparera enkelsträngade DNA-skador. Huvudskillnaden mellan reparation av bas excision och reparation av nukleotid excision är att reparation av bas excision är ett enkelt reparationssystem som fungerar i cellerna för att reparera enstaka nukleotidskador som orsakas endogent medan nukleotid excision reparation är ett komplext reparationssystem som fungerar i cellerna för att reparera relativt större, skadade regioner orsakade exogent.
INNEHÅLL
1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är reparation av basutsnitt
3. Vad är reparation av
skärning av nukleotid 4. Jämförelse vid sida vid sida - Reparation av basskärning jämfört med reparation av skärning av nukleotid
5. Sammanfattning
Vad är Base Excision Repair?
Bas excision reparation är den enklaste versionen av DNA-reparationssystem som cellerna har. Det används för att reparera mindre skador i DNA. DNA-baser modifieras på grund av deaminering eller alkylering. När det finns basskador känner igen och aktiverar DNA-glykosylas basexcisionsreparationssystemet och återvinner det med hjälp av enzymerna AP-endonukleas, DNA-polymeras och DNA-ligas. Följande steg är inblandade i BER-systemet.
- Erkännande och avlägsnande av en felaktig eller skadad bas av ett DNA-glykosylas för att skapa ett abasiskt ställe (ställen med basförlust –apiurin- eller apyrimidin-platser).
- Abasiskt snitt genom en apurinisk / apyrimidinisk endonukleas
- Avlägsnande av det återstående sockerfragmentet med ett lyas eller fosfodiesteras
- Gap fyllning med ett DNA-polymeras
- Försegling av nicket med ett DNA-ligas
Figur 01: Reparationsväg för basskärning
Vad är Nucleotide Excision Repair?
Nucleotide Excision Repair (NER) är ett viktigt DNA-excisionsreparationssystem i celler. Den kan reparera och ersätta skadade områden upp till 30 baser i längd och styrs av den oskadade mallsträngen. Vanliga DNA-skador inträffar på grund av ultraviolett strålning och NER skyddar DNA genom att reparera dessa skador omedelbart innan de blir mutationer och övergår till framtida generationer eller orsakar sjukdomar. NER ger specifikt skydd mot mutationer som orsakas indirekt av exogena faktorer som miljö- och kemiska cancerframkallande ämnen. NER ses i nästan alla organismer, och det känner igen skador som orsakar betydande förvrängning i DNA-spiralen.
NER-processen involverar verkan av många proteiner som XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, etc. och fortsätter via flera klipp- och klisterliknande mekanismer. Dessa proteiner är viktiga för att slutföra reparationsprocessen, och en defekt i ett av NER-proteinerna är viktigt och kan orsaka sällsynta recessiva syndrom: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayne syndrom (CS) och den ljuskänsliga formen av den spröda hårstörningen trichothiodystrophy (TTD).
Figur 02: Nucleotide Excision Repair
Vad är skillnaden mellan Base Excision Repair och Nucleotide Excision Repair?
Skilja artikeln mitt före bordet
Base Excision Repair vs Nucleotide Excision Repair |
|
| Base excision repair (BER) är ett DNA-reparationssystem som förekommer i celler. | Nucleotide excision repair (NER) är en annan typ av DNA-reparationssystem som finns i celler. |
| Identifiera DNA-addukter | |
| BER reparerar skador på små DNA-addukter. | NER reparerar stora DNA-addukter. |
| DNA-skador | |
| BER känner igen skadorna som inte orsakar betydande snedvridningar av DNA-spiralen. | NER känner igen de skador som orsakar betydande snedvridningar i DNA-spiralen. |
| Orsaker till DNA-skador | |
| BER reparerar skador orsakade av endogena mutagener. | NER reparerar skador orsakade av exogena mutagener. |
| Komplexitet | |
| BER är det minst komplexa reparationssystemet | Det är mer komplicerat än BER. |
| Behov av proteiner | |
| BER kräver inte andra proteiner. | NER kräver flera genprodukter, särskilt proteiner, för att diskriminera skadade och oskadade regioner. |
| Lämplighet | |
| BER är lämplig för att korrigera skador på en bas. | NER är lämplig för att ersätta de skadade områdena. |
Sammanfattning - Base Excision Repair vs Nucleotide Excision Repair
NER och BER är två typer av DNA-excisionsreparationsprocesser som finns i celler. BER kan reparera små skador orsakade endogent medan NER kan reparera skada regioner upp till 30 baspar längd orsakad mestadels av exogent. BER skiljer sig från NER i de typer av substrat som känns igen och i den initiala klyvningshändelsen. BER kan också känna igen skador som inte orsakades av signifikanta snedvridningar i DNA-spiralen medan NER känner igen signifikanta snedvridningar av DNA-spiralen. Detta är skillnaden mellan bas excision reparation och nukleotid excision.
Bild med tillstånd:
1.”Dna reparation bas excersion sv” Av LadyofHats - (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. “En schematisk framställning av modeller för nukleotid excision reparationsväg kontrollerad av Uvr proteiner” Av Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui och Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) via Commons Wikimedia
