Huvudskillnaden mellan endoparasiter och ektoparasiter är att endoparasiterna är parasitära organismer som lever inuti värdorganismen medan ektoparasiter är parasitära organismer som lever utanför värden, främst på huden.
En parasit är en organism som lever på eller i en annan organism som kallas värden. Parasiten får näringsämnen från värden. Parasitism är förhållandet mellan värd och parasit. Parasiter är alltid beroende av en värd och de kan inte leva utan värden. Detta förhållande är skadligt för värden, men det är fördelaktigt för parasiten. Detta kan orsaka svåra sjukdomar hos värdarna. Ibland kan parasiter till och med döda värden. Många parasiter har komplexa livscykler som behöver flera värdar för tillväxt och reproduktion. För det har de förvärvat många unika anpassningar som kan ändra värdens beteende och göra dem mer sårbara för sina rovdjur. Denna process möjliggör överföring av parasitsteg från en värd till en annan. Beroende på parasitternas levande miljö,de kan klassificeras som endoparasiter och ektoparasiter.
