Huvudskillnaden mellan tardiv dyskinesi och dystoni är att tardiv dyskinesi alltid är sekundär till den långvariga användningen av neuroleptika, men dystoni kan bero på olika andra orsaker. Vidare är dystoni den onormala muskeltonen som resulterar i muskelspasmer eller onormala hållningar. Medan tardiv dyskinesi avser okontrollerbar munhår och läppsmackande grimaser som utvecklas efter långvarig användning av neuroleptika.
Båda dessa tillstånd är onormala rörelsestörningar; dystonier inkluderar en mängd rörelsestörningar som uppstår på grund av olika anledningar medan tardiv dyskinesi bara är en undergrupp av primära dystonier.