Huvudskillnaden mellan genetiskt material av prokaryoter och eukaryoter är att genetiskt material av prokaryoter flyter i cytoplasman eftersom de inte har en kärna medan det genetiska materialet av eukaryoter finns inne i kärnan. En annan viktig skillnad är att prokaryoter har ett litet genom och innehåller plasmider. De har också en stor lindad dubbelsträngad cirkulär kromosom medan eukaryoter har ett större genom och inte har plasmider.
Prokaryoter och eukaryoter är två typer av organismer. Bakterier och Archaea är prokaryoter. Prokaryoter har en enkel mobilorganisation. De har ingen kärna och sanna organeller. Å andra sidan har eukaryoter en komplex cellorganisation med en membranbunden kärna och sanna organeller. Svampar, protister, växter och djur är eukaryoter.