Huvudskillnaden mellan allel och locus är att allelen hänvisar till en av de två eller flera alternativa sekvenserna av en gen vid ett visst lokus medan locus hänvisar till en viss plats på en kromosom där en gen kan hittas.
I form av gener ärver genetisk information från föräldrar till avkomma. Gener är de specifika nukleotidsekvenserna som finns i kromosomerna. Många gener finns i genomets organism. Deras arrangemang i genomet är exakt och genens placering kan lätt hittas med hjälp av en genetisk markör. Dessutom kan en viss gen ha olika versioner som vi kallar alleler. Den specifika platsen för en gen i kromosomen är också mycket viktig, och vi kallar det ett lokus.
