Huvudskillnaden mellan protoxylem och metaxylem är att protoxylem är den första bildade primära xylem som har mindre celler, särskilt smala kärl och tracheider medan metaxylem är den senare bildade primära xylem som har större celler, särskilt bredare kärl och tracheider.
Xylem är en av de två typerna av kärlvävnader i växter. Xylem driver uppåtgående rörelser av vatten och mineraler från rötterna till de andra delarna av växten. Det är en rörliknande struktur som innehåller olika typer av specialiserade celler inklusive kärlelement, trakeider, parenkym och fibrer. Det finns två typer av xylems som primära xylem och sekundära xylem. Primär xylem utvecklas under primär tillväxt. Dessutom har primär xylem två delar: protoxylem och metaxylem. Både protoxylem och metaxylem härstammar från pro-kambiet under den primära tillväxten. Protoxylem har sitt ursprung först och metaxylem har sitt ursprung efter protoxylem.