Huvudskillnaden mellan prokaryota och eukaryota ribosomer är att de prokaryota ribosomerna är 70S-partiklar som består av 50S stor underenhet och 30S liten underenhet medan de eukaryota ribosomerna är 80S-partiklar som består av 60S stor underenhet och en 40S liten underenhet.
Prokaryoter och eukaryoter är två huvudgrupper av levande organismer som skiljer sig från den cellulära organisationen. Prokaryoter har inte kärnor och membranbundna cellorganeller. Å andra sidan har eukaryoter en kärna och membranbundna cellorganeller. Det finns några organeller som är gemensamma för båda organismerna. Ribosomen är en av de viktiga och vitala organeller som finns i både prokaryota och eukaryota celler. De finns i cytoplasman i varje cell. Strukturellt utgör protein och ribosomalt RNA (rRNA) tillsammans ribosomer. Och de består av två underenheter, nämligen större underenhet och en liten underenhet. De utför också samma funktion som är översättningen av mRNA-molekyler till proteiner. Eftersom översättning är en viktig process för alla levande organismer och den förekommer i ribosomerna,ribosomer är mycket viktiga för både prokaryoter och eukaryoter. Trots att de har många likheter finns det vissa skillnader mellan prokaryota och eukaryota ribosomer.