Huvudskillnaden mellan förmörkelse och latent period är att förmörkelseperioden är tiden för att syntetisera fagproteiner och nukleinsyror inuti värdcellen, medan den latenta perioden är tiden mellan injektionen av virusgenomet i cellen och värdcellslisen.
En bakteriofag (fag) är en obligatorisk intracellulär viruspartikel som infekterar och sprider sig i en specifik bakterie. Dessa är också kända som bakterieätare eftersom de fungerar som bakteriedödande medel. Huvud- och svansform är den vanligaste formen som bakteriofager visar. De infekterar värdbakterierna för att reproducera sig. I början av infektionen fäster de tätt på bakteriecellväggen med hjälp av deras ytreceptorer och injicerar sitt genetiska material i värdcellen. Då kan deras infektion inträffa via två cykler: lytisk och lysogen cykel.
I den lytiska cykeln infekterar bakteriofager bakterier och dödar snabbt värdbakteriecellen genom lys. I den lysogena cykeln integreras viralt genetiskt material med bakteriellt genom eller plasmider och existerar i värdcellen i många generationer utan att döda värdbakterien. Infektionsprocessen följer olika perioder som latent period, förmörkelseperiod, stigningsperiod etc.