Huvudskillnaden mellan endosymbios och symbios är att endosymbios är en teori som beskriver hur mitokondrier och kloroplaster kom in i eukaryota celler medan symbios är en långvarig interaktion mellan två olika levande arter.
Organismer i ett ekosystem interagerar med varandra på olika sätt. Symbios är en interaktion som finns mellan två olika arter som lever tillsammans. Vissa interaktioner gynnar båda parter, medan vissa interaktioner förblir neutrala. Vissa andra interaktioner är dock skadliga för en part, särskilt för värdorganismen, medan den andra parten får fördelar på värdens bekostnad. Vi kan se alla dessa typer av interaktioner i ett ekosystem. Denna typ av interaktioner är dock avgörande för ett ekosystems stabilitet. Endosymbios, å andra sidan, är en teori som förklarar den eukaryota cellens ursprung från en prokaryot cell.
