Huvudskillnaden mellan primär och sekundär kinetisk isotopeffekt är att primär isotopeffekt beskriver den isotopiska substitutionen vid den trasiga bindningen medan sekundär isotopeffekten beskriver den isotopiska substitutionen vid bindningen intill den trasiga bindningen.
Kinetisk isotopeffekt eller KIE hänvisar till förändringen i reaktionshastigheten för en kemisk reaktion efter substitution av en isotop. Här ersätts en atom i en reaktant med dess isotop så att reaktionshastigheten skulle skilja sig från den initiala hastigheten. Sedan kan vi bestämma ett värde för KIE genom att dela hastighetskonstanten för reaktionen som involverar den lätta isotopiskt substituerade reaktanten från hastighetskonstanten för reaktionen som involverar den tunga isotopiskt substituerade reaktanten. Därför betraktas KIE större än 1 som normal kinetisk isotopisk effekt medan KIE mindre än 1 betraktas som en invers kinetisk isotopisk effekt.
