Huvudskillnaden mellan oligopeptid och polypeptid är att oligopeptider innehåller få aminosyrarester, medan polypeptider innehåller ett stort antal aminosyrarester.
Termerna oligopeptider och polypeptider faller under kategorin proteiner. Peptider är korta kedjor av aminosyror. Aminosyror binder med varandra genom peptidbindningar. Därför kan vi kategorisera dessa peptider efter antalet aminosyror som finns i dessa peptider. Exempelvis dipeptider, tripeptider, tetrapeptider, oligopeptider och polypeptider.