Huvudskillnaden mellan Prostaglandin El och E2 är att prostaglandinet El (PGE1) är en antiinflammatorisk faktor medan Prostaglandin E2 (PGE2) är en proinflammatorisk faktor.
Prostaglandiner är lipid-härledda föreningar som har en hormonliknande funktion. De kan fungera som autokrina eller parakrina föreningar som orsakar antagonistiska eller synergistiska effekter i de levande organismerna. Prostaglandin E1 och prostaglandin E2 är två typer, och de skiljer sig åt när det gäller inflammation. Både prostaglandin El och E2 tillhör samma familj av prostaglandin E2, och deras reaktionsgrund och deras effekter är ännu inte klarlagda. De används vid behandlingar av olika biokemiska mekanismer hos levande varelser.