Huvudskillnaden mellan hyaloplasma och cytosol är frånvaron och närvaron av cellorganeller. Hyaloplasma består av strukturlös vätska medan cytosol består av flytande och strukturerade organeller.
Hyaloplasma och cytosol är organiska flytande ämnen som finns i en cell. De kan observeras i prokaryota celler såväl som eukaryota celler. Hyaloplasman hänför sig till den flytande delen av cytosolen, som inte innehåller några strukturer. I jämförelse är cytosol en flytande fas som består av strukturella komponenter i en cell bortsett från kärnan.