Huvudskillnaden mellan glykogen och glukos är att glykogen är en polysackarid som lagrar kolhydrater i djur och svampar medan glukos är den vanligaste monosackariden som fungerar som den primära energikällan i celler.
Kolhydrater är organiska föreningar som kännetecknas av kol-, väte- och syreelement. Förhållandet väte till syre är 2: 1 i kolhydrater, liknar vatten. Kolhydrater är mycket viktiga utbredda biologiska föreningar eftersom de är den viktigaste energikällan och den strukturella beståndsdelen i protoplasman. I allmänhet är kolhydrater vita, fasta och lösliga i organiska vätskor förutom vissa polysackarider. Monosackarider är de grundläggande enheterna i kolhydratmolekyler och glukos är den viktigaste av dessa. Glykogen är också ett kolhydrat. Men det är en polysackarid som bildas av anabolism av glukosmolekyler till en grenad molekyl. Både glukos och glykogen är viktiga för kroppens energiproduktion. Glukos är det viktigaste bränslet för energiproduktion, och glykogen är en typ av sekundär,långvarig energilagring hos djur och svampar.