Huvudskillnaden mellan D- och L-glukos är att i D-glukos finns tre hydroxylgrupper och en vätegrupp på höger sida, medan i L-glukos finns de tre hydroxylgrupperna och en vätegrupp på vänster sida.
"D" och "L" bokstavsindikering i namnen på D-glukos och L-glukos används för att skilja de strukturella skillnaderna i glukosmolekylen. Dessa två former kallas enantiomerer eftersom deras molekylära strukturer är spegelbilder av varandra. Därför ligger huvudskillnaden mellan D- och L-glukos i deras struktur. Vi kan förklara skillnaderna i deras former med hjälp av Fisher-projiceringsmodellen; det är ett av sätten att rita organiska molekyler.