Huvudskillnaden mellan kapsid och kapsomer är att kapsid är proteinbeläggningen som omger och skyddar virusgenomet medan kapsomer är den strukturella underenheten av en viral kapsid och aggregering av flera protomerer som en enhet.
Virus är intracellulära parasiter. De är alla smittsamma och orsakar olika typer av sjukdomar hos växter, djur, protister, bakterier och svampar. Det finns två huvudkomponenter som skapar ett virus. De är proteinskalet och nukleinsyragenomet. Proteinskal, även känt som kapsid, består av proteiner. Huvudfunktionen för kapsiden är att skydda virusgenomet och underlätta infektionsprocessen. En kapsid består av kapsomerer, som är de strukturella och morfologiska underenheterna i den virala kapsiden. Kapsomerer monteras själva snyggt och ger den virala kapsiden form i varje viruspartikel. Strukturellt sett är capsomere en sammanställning av flera protomerer som en enhet.