Huvudskillnaden mellan sammansatta och icke-sammansatta transposoner är att komposit-transposoner har två flankerande insättningssekvenser medan icke-komposit-transposoner har inverterade upprepningar istället för flankerande insättningssekvenser.
Ett transposon är ett fragment av DNA som kan translokera i bakterien genomet. De är mobila DNA-sekvenser. De flyttar in på nya platser i genomet. Dessa rörelser gör förändringar i sekvensen för bakteriegenomet, vilket orsakar betydande förändringar i genetisk information. De är de transponerbara genetiska elementen som är ansvariga för att etablera nya genetiska sekvenser i bakterier. Transposoner kallas också hoppande gener eftersom dessa hoppsekvenser kan blockera transkriptionen av gener och omorganisera bakteriens genetiska material. Dessutom är de ansvariga för rörelsen av läkemedelsresistens, antibiotikaresistensgener mellan plasmider och kromosomer. Det finns två typer av transposoner som sammansatta och icke-sammansatta transposoner.
