Nyckelskillnad - Genotypning vs sekvensering
Genotypning och sekvensering är två tekniker som utförs för att få information om nukleinsyrorna, huvudsakligen DNA i en organism. Huvudskillnaden mellan genotypning och sekvensering är att genotypning är processen för att bestämma vilken genetisk variant individen har med hjälp av markörer medan sekvensering är bestämningen av den korrekta ordningen för nukleotidsekvensen inom det givna DNA-fragmentet.
INNEHÅLL
1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är genotypning
3. Vad är sekvensering
4. Jämförelse sida vid sida - Genotypning vs sekvensering
5. Sammanfattning
Vad är genotypning?
Genotypning är bestämningen av en individs genetiska sammansättning med hjälp av en sekvens av DNA och markörer och jämförelse och identifiering av dess arv. Genotypning är viktigt i evolutionens biologi, populationsbiologi, taxonomi, ekologi och genetik hos organismerna. Det kan utföras med olika tekniker inklusive DNA-sekvensering, polymeraskedjereaktion, restriktionsfragmentlängdspolymorfism (RFLP), slumpmässigt förstärkt polymorf detektion, amplifierad fragmentlängdpolymorfism (AFLP), DNA-mikroarrays, etc.
Genotypning involverar sekvensering av speciella små fragment av DNA-sekvenser och upptäckt av släkt med den genetiska kompositionen med andra individer som använder genetiska markörer. Det bestämmer de enskilda nukleotidpolymorfierna (SNP) bland individerna eller de specifika allelerna. Genotypning är tillämplig på ett brett spektrum av organismer inklusive människor. Det är också tillämpligt på mikroorganismer såsom virus, svampar etc. och kan användas för att bestämma deras genetiska varianter med referensprofilerna. I molekylär epidemiologi och rättsmedicinsk mikrobiologi görs kontroll av patogener, särskilt mikroorganismer, genom information som erhållits från genotypning. Genotypning är mycket viktigt i stamtavla analys. Människor är genotypade för att bekräfta moderskap och faderskap. Genotyp avslöjar de dominerande och recessiva allelerna av gener som bestämmer specifika egenskaper.
Figur_1: RFLP-genotypning
Vad är sekvensering?
Sekvensering är processen att bestämma den korrekta ordningen på nukleotiden i ett givet DNA-fragment. Praktiskt taget all information som krävs för tillväxt och utveckling av en organism är kodad i dess genom. Tillgängligheten av tekniker för att producera och separera några hundra nukleotider långa nukleinsyrafragment ledde till utvecklingen av förfaranden för bestämning av den exakta nukleotidsekvensen för ett givet fragment av DNA eller RNA. Olika typer av sekvenseringsmetoder finns idag. Dessa sekvenseringsmetoder, tillsammans med teknologierna för konstruktion av genombibliotek som representerar hela en organisms genom, underlättar sekvensering av hela genomet i den organismen, vilket gör en fördjupad analys av genstrukturer, genfunktioner, genplatser, genuttryck, genkartläggning, genreglerande regioner etc.
Det totala genomet för många virus, flera bakterier, arkebakterier, jäst och flera andra organismer har sekvenserats och kartlagts. Mänskligt genomprojekt har gjort det möjligt att sekvensera och kartlägga hela det mänskliga genomet och publicera sitt första utkast 2003. Det är en viktig milstolpe i utvecklingen av biologin. Mänskliga genomsekvenser används nu inom den medicinska sektorn för att identifiera genetiska orsaker till sällsynta sjukdomar, screena sjukdomsrisk hos nyfödda, identifiera genetiska detaljer om olika cancerformer, utveckla nya terapier och utveckla nya diagnostiska verktyg etc.
I växtvärlden har genom genom ris och Arabidopsis sekvenserats. Kunskap om dessa sekvenser kommer utan tvekan att revolutionera vår förståelse för hur celler och organismer fungerar.
Figur_2: En autoradiografi av sanger-sekvensering
Vad är skillnaden mellan genotypning och sekvensering?
Skilja artikeln mitt före bordet
Genotypning vs sekvensering |
|
| Genotypning är processen för att bestämma en individs genetiska sammansättning och kontrollera gruppens eller taxonomin för den organismen. | Sekvensering är processen för att bestämma den exakta ordningen på nukleotider av ett givet DNA- eller RNA-fragment. |
| Tekniker | |
| RFLP, gensekvensering, PCR, DNA-mikroarrays, AFLP etc. | Sanger-sekvensering, Gilbert-sekvensering, Pyrosekvensering, Next Generation-sekvensering, Hagelgevärssekvensering etc. |
| Stora bekymmer | |
| Detta är mer bekymrat över om genotypskillnaderna ger de faktiska skillnaderna i fenotyp. | Detta är mer bekymrat över nukleotidernas ordning och dess skillnader och förändringar med andra organismer. |
Sammanfattning - Genotypning vs sekvensering
Genotypning och sekvensering är användbara för att studera organismernas genetiska information. Genotypning är processen för att bestämma genotypvariationer bland individer och hitta deras kategorier. Sekvensering är processen att bestämma den korrekta ordningen på nukleotiderna i det intresserade fragmentet eller DNA-regionen. Båda teknikerna ger viktig information om gener och genom.
