Nyckelskillnad - Proteomics vs Transcriptomics
Den omiska tekniken är en aktuell trend, där de olika biomolekylerna i en organism ses på som en hel samling med avseende på dess egenskaper och funktioner. Omic-tekniken har ett brett utbud av applikationer. De olika omicsna i ett biologiskt prov inkluderar genomics, proteomics, transcriptomics och metabolomics. Proteomics involverar en fullständig studie av alla proteiner i en levande organism. Det definieras som uppsättningen av alla uttryckta proteiner i en organism, dess strukturella och funktionella egenskaper. Den kompletta uppsättningen proteiner bildar därför proteomen. Transcriptomics är den fullständiga studien av alla budbärar-RNA (mRNA) -molekyler som finns i en levande organism. Således handlar transkriptomik om gener som uttrycks aktivt i en levande organism. Den totala uppsättningen mRNA i en levande organism kallas transkriptomen. Huvudskillnaden mellan Proteomics och Transcriptomics baseras på typen av biomolekyl. I proteomik studeras den totala uppsättningen uttryckta proteiner i en levande organism medan transkriptomik studerar den totala mRNA-en för en levande organism.
INNEHÅLL
1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är Proteomics
3. Vad är Transcriptomics
4. Likheter mellan Proteomics och Transcriptomics
5. Jämförelse sida vid sida - Proteomics vs Transcriptomics i tabellform
6. Sammanfattning
Vad är Proteomics?
Termen proteomics myntades 1995 och definierades initialt som det totala proteinkomplementet i en cell, vävnad eller en organism. Med framstegen i proteomiska studier modifierades den sedan för att betraktas som ett paraplybegrepp där många studieområden inkluderades. För närvarande studeras strukturen, orienteringen, funktionerna, dess interaktioner, dess modifieringar, dess applikationer och betydelsen av proteiner under ämnet proteomik. Därför bedrivs för närvarande mycket forskning inom proteomikområdet.
De första proteomiska studierna gjordes för att identifiera proteinhalten i Escherichia coli. Kartläggningen av det totala proteininnehållet gjordes med användning av tvådimensionella (2D) geler. Efter framgången med detta gick forskarna vidare till att karakterisera det totala proteininnehållet i djur som marsvin och möss. För närvarande görs humanproteinkartläggning med 2D-gelelektrofores.
Tillämpningar av Proteomics
Det finns många fördelar med att studera proteomik, eftersom proteiner är de styrande molekylerna för det mesta av aktiviteten på grund av proteinkatalysatoregenskapen. Således kan studien av hela proteiner ge information om hälsotillståndet hos en organism. Vissa applikationer är;
- Genomnotering: Genom att studera en organisms proteininnehåll kan de exakta genomerna som är ansvariga för den aktiva proteinföreningen bestämmas. I detta scenario är resultat från all genomik, Transcriptomics och proteomics viktiga.
- Sjukdomsidentifiering / diagnostik: Proteomik används vid identifiering av sjukdomstillståndet genom att jämföra friska och sjuka
- Att utföra proteinuttryck som studerats under experiment.
- Proteinmodifieringar och interaktionsstudier: För att använda proteiner in vitro-förhållanden eller och in vivo-förhållanden, bestämma lagringsförhållandena för dessa extraherade proteiner och för att studera proteinets beteende in vitro-, in vivo- och in-silico-metoder.
Figur 01: Proteomics
Det finns olika tekniker involverade i proteomik
- Extraktion av det totala proteinet och separering av proteinerna med 2D-gelelektrofores. Proteiner kan också separeras med högpresterande vätskekromatografi (HPLC).
- Sekvensering av de extraherade proteinerna med metoder som Edmunds sekvenseringsmetod eller masspektrometri.
- När sekvenserna har identifierats analyseras strukturella och funktionella egenskaper hos proteininnehållet med hjälp av datorbaserad programvara och bioinformatikverktyg.
Vad är Transcriptomics?
Transcriptome-termen myntades nyligen. Transcriptomics är studien av det totala mRNA-innehållet i en organism. Det totala mRNA är det uttryckta DNA i en levande organism eller en cell. Den kompletta samlingen av mRNA kallas en transkriptom.
Stegen mot att analysera transkriptomen inkluderar,
- Extraktion av RNA, separation av mRNA med kolonngelkromatografi med poly-DT-pärlor.
- Sekvenseringen av mRNA görs.
Microarray-teknik är ett vanligt sätt att identifiera transkriptomen på en organism. Microarray-tekniken involverar en sondplatta med transkriptomens komplementära strängar. Vid hybridisering kan mRNA som finns i organismen eller cellerna karakteriseras.
Figur 02: Transkriptomiska tekniker
Transkriptomik används nu allmänt inom det medicinska området. Sjukdomsdiagnostik och sjukdomsprofilering är huvudområden där Transcriptomics används. Genom att analysera en transkriptom av en organism kan främmande mRNA identifieras, och om det finns några infektioner kan det identifieras. Det icke-kodande RNA kan separeras med hjälp av transkriptomisk teknik. Och även uttryck av gener under olika miljöbelastningar kan övervakas.
Vad är likheterna mellan Proteomics och Transcriptomics?
- Båda utgör en del av begreppet omisk teknik.
- Båda används vid sjukdomsdiagnostik och sjukdomskarakterisering av en organism.
- Båda studieområdena involverade extraktion av biomolekylen, separering av biomolekylen och sekvenseringssteg.
Vad är skillnaden mellan Proteomics och Transcriptomics?
Skilja artikeln mitt före bordet
Protemics vs Transcriptomics |
|
| Proteomics involverar en fullständig studie av alla proteiner i en levande organism. | Transcriptomics är den fullständiga studien av alla budbärar-RNA (mRNA) -molekyler som finns i en levande organism. |
| Studerade biomolekyltyp | |
| Proteiner studeras i proteomik. | mRNA studeras i transkriptomik. |
| Faktorer studerade | |
| Proteins struktur, funktion, interaktioner, modifieringar och tillämpningar studeras i proteomik. | Sekvensstruktur, interaktioner med miljö och tillämpningar av mRNA studeras i transkriptomik. |
Sammanfattning - Proteomics vs Transcriptomics
Omics spelar en viktig roll inom biovetenskap. Proteomics hänvisar till studien av proteomen som bildar de fullständiga proteinsamlingarna i en cell eller en organism. Transcriptomics hänvisar till studien av transkriptomen, som är den kompletta uppsättningen av uttryckt DNA som är i form av mRNA. De två studieområdena, proteomik och transkriptomik, härleddes efter introduktion av genomik och används för närvarande allmänt inom medicinsk diagnostik och i karakterisering och screening av organismer. Detta är skillnaden mellan proteomik och transkriptomik.
Ladda ner PDF-filen från Proteomics vs Transcriptomics
Du kan ladda ner PDF-versionen av den här artikeln och använda den för offlineändamål enligt citat. Ladda ner PDF-versionen här: Skillnaden mellan Proteomics och Transcriptomics
