Huvudskillnaden mellan pluripotenta och inducerade pluripotenta stamceller är att de pluripotenta cellerna är odifferentierade moderceller (från embryon etc.), som har den naturliga förmågan att differentiera till olika celltyper medan de inducerade pluripotenta stamcellerna är somatiska vuxna celler som har har omprogrammerats genetiskt för att visa egenskaper som liknar naturliga pluripotenta stamceller.
En stamcell är en odifferentierad cell som har den unika förmågan att utvecklas till olika eller specialiserade celler. Dessutom är stamceller av tre typer, nämligen unipotenta, pluripotenta och multipotenta. Om en stamcell kan differentieras till en, flera och i alla celltyper, är den känd som unipotent, multipotent eller pluripotent stamcell. Bland de tre ovanstående typerna är pluripotenta stamceller viktiga eftersom de kan differentieras till alla celltyper. En pluripotent embryonal stamcell kan utvecklas till en hel människa.
