Huvudskillnaden mellan embryonala och somatiska stamceller är att de embryonala stamcellerna är pluripotenta odifferentierade celler som har embryonalt ursprung medan somatiska stamceller är multipotenta odifferentierade celler som har vävnads- och organsprung.
Stamceller är odifferentierade celler som kan växa till sanna vävnader eller organ. Generellt finns det två huvudstamcellstyper som embryonala stamceller och vuxna stamceller (somatiska stamceller). När det gäller differentiering kan embryonala stamceller differentieras till vilken typ av celler som helst. Däremot kan somatiska stamceller bara differentieras till flera vävnadsspecifika celler. Därför är embryonala stamceller pluripotenta medan somatiska stamceller är multipotenta. Med enkla ord är differentieringsförmågan hög i embryonala stamceller jämfört med somatiska stamceller.
