Huvudskillnaden mellan pluripotenta och multipotenta stamceller är att de pluripotenta cellerna har förmågan att differentiera sig till vilken celltyp som helst i de tre groddskikten medan de multipotenta stamcellerna har förmågan att utvecklas till ett begränsat antal specifika celltyper.
Vissa celler har förmågan att differentiera sig till andra typer av specialiserade celler. Denna förmåga kallas cellstyrka. När en cell kan differentiera sig till fler celltyper har den specifika cellen stor styrka. På samma sätt har stamcellerna stor cellkraft. De är odifferentierade celler från flercelliga organismer som kan dela sig snabbt och differentieras till andra celltyper. Följaktligen finns det två huvudtyper av stamceller. De är nämligen embryonala stamceller och vuxna stamceller. Baserat på förmågan att differentiera i celltyper är vissa stamceller totipotenta medan andra är pluripotenta och multipotenta. Pluripotenta stamceller kan bli vilken typ av celler som helst i de tre groddlagren medan multipotenta stamceller kan differentieras till specifika celltyper. Följaktligen är embryonala stamceller pluripotenta celler. Å andra sidan är blodstamceller multipotenta stamceller.
