Huvudskillnaden mellan antigen och patogen är att antigen är ett främmande ämne, toxin eller en molekyl som kan stimulera ett immunsvar för att producera antikroppar mot det medan patogen är en organism, särskilt en mikrobe, som infekterar vår kropp och orsakar sjukdomar.
Patogener är alla främmande organismer som orsakar sjukdomar hos värdplanter och djur. Ett antigen är en molekyl som ligger i cellväggen av bakterier eller beläggningen av organismer. Antigen får vårt immunsystem att producera antikroppar mot det och skydda vår kropp från skadliga främmande organismer.
