Nyckelskillnad - CRISPR vs RNAi
Genomredigering och genmodifiering är kommande intresseområden för genetik och molekylärbiologi. Genmodifiering är allmänt användbar för genterapistudier och används också för att identifiera genens egenskaper, genens funktionalitet och hur mutationer i genen kan påverka dess funktion. Det är viktigt att utveckla effektiva och tillförlitliga sätt att göra exakta, målinriktade förändringar i genomet hos levande celler. Tekniker som CRISPR och RNAi används för att modifiera gener med hög precision. CRISPR eller Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats är en naturligt förekommande prokaryot immunförsvarsmekanism som nyligen har använts för eukaryot genredigering och modifiering. RNAi eller RNA-interferens är en sekvensspecifik metod för att tysta gener genom att införa liten dubbelsträngad RNA som förmedlar med nukleinsyror och reglerar genuttryck. Detta är nyckelskillnaden mellan CRISPR och RNAi.
INNEHÅLL
1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är CRISPR
3. Vad är RNAi
4. Likheter mellan CRISPR och RNAi
5. Jämförelse sida vid sida - CRISPR vs RNAi i tabellform
6. Sammanfattning
Vad är CRISPR?
CRISPR-systemet är en naturlig mekanism som finns i vissa bakterier inklusive E. coli och archea. Det är ett adaptivt immunskydd mot främmande DNA-baserade invasioner. Det är en sekvensspecifik mekanism. CRISPR-systemet innehåller flera DNA-upprepningselement. Dessa element är blandade med korta "spacer" -sekvenser härledda från främmande DNA och flera Cas-gener. Några av Cas-generna är nukleaser. Således kallas hela immunsystemet CRISPR / Cas-system.
Figur 01: CRISPR / Cas-system
CRISPR / Cas-systemet fungerar i fyra steg.
- Systemet är genetiskt bundna invaderande fag- och plasmid-DNA-segment (distanser) i CRISPR-loci (kallas distansupptagningssteget).
- mognadssteg för crRNA - Värden transkriberar och bearbetar CRISPR loci för att generera moget CRISPR-RNA (crRNA) som innehåller både CRISPR-repeteringselement och de integrerade distanselementen.
- Detektion av crRNA - Detta underlättas genom kompletterande basparning. Detta är viktigt när en infektion är närvarande och ett infektiöst medel är närvarande.
- Målstörningssteg - crRNA detekterar främmande DNA, bildar ett komplex med främmande DNA och skyddar värden mot främmande DNA.
För närvarande används CRISPR / Cas-systemet för att ändra eller modifiera däggdjursgenom genom antingen transkriptionsundertryckning eller aktivering. Däggdjurscellerna kan svara på CRISPR / Cas9-medierad DNA-avbrott genom att anta reparationsmekanism. Det kan antingen göras med hjälp av icke-homolog slutförbindningsmetod (NHEJ) eller homologiriktad reparation (HDR). Båda dessa reparationsmekanismer äger rum genom att införa dubbelsträngade pauser. Detta resulterar i redigering av däggdjursgenen. Således används för närvarande CRISPR / Cas-systemet inom terapeutiska, biomedicinska, jordbruks- och forskningsapplikationer.
Vad är RNAi?
RNA-interferens är en dubbelsträngad RNA-medierad teknik som används för att reglera genuttryck. Den viktigaste föreningen är små interfererande RNA (siRNA). SiRNA är en speciell typ av dubbelsträngade RNA med ett 3'-överhäng av två nukleotider och en 5'-fosfatgrupp. Det RNA-inducerade tystnadskomplexet (RISC) bildas under RNA-interferens vilket skulle resultera i nedbrytning av genen bunden till siRNA.
Figur 02: RNAi
Proceduren för RNAi är som följer.
- Det dubbelsträngade RNA kommer att bearbetas i cytoplasman av en endoribonukleas av RNase III-typ som heter Dicer för att generera ~ 21 nukleotid långa siRNA
- Överföring av siRNA-bunden Dicer till Argonaute, med hjälp av dubbelsträngade RNA-bindande proteiner (dsRNABP).
- Bindning av Argonaute till en tråd i duplexen (styrsträng). Detta kommer att förskjuta den andra strängen. Detta resulterar i ett helt protein - RNA-komplex som kallas RISC.
- Parningen av RISC-komplexet med enkelsträngat styr-RNA bundet till Argonauten.
- Parningen av det homologa RNA-målet med styr-RNA.
- Aktivering av Argonaute resulterar i nedbrytning av mål-RNA
Vad är likheten mellan CRISPR och RNAi?
Båda används som genuttryck som modifierar forskningsverktyg
Vad är skillnaden mellan CRISPR och RNAi?
Skilja artikeln mitt före bordet
CRISPR vs RNAi |
|
| CRISPR är en immunförsvarsmekanism som nyligen har använts för redigering och modifiering av eukaryot gen. | RNAi är en sekvensspecifik metod för att tysta gener genom att införa små dubbelsträngade |
| Riktningssekvens | |
| Syntetiskt RNA (guide RNA) är målsekvensen för CRISPR. | siRNA är målsekvensen för RNAi. |
| Effektivitet vid genundertryckning | |
| Låg CRISPR | Högt i RNAi |
| Effekter | |
| Nedbrytning av gener sker i CRISPR. | Knockout / tystning sker i RNAi. |
Sammanfattning - CRISPR vs RNAi
CRISPR eller Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats är en naturligt förekommande prokaryot immunförsvarsmekanism som nyligen har använts för eukaryot genredigering och modifiering. RNAi eller RNA-interferens är en sekvensspecifik metod för att tysta gener genom att införa liten dubbelsträngad RNA som medierar med nukleinsyror och reglerar genuttryck. Detta kan ses som den grundläggande skillnaden mellan CRISPR och RNAi. Båda teknikerna, CRISPR / Cas och RNAi, är kraftfulla verktyg för genmanipulationer, även om CRISPR / Cas verkligen är mer överlägsen RNAi eftersom det kan användas för att inducera både insättningar och raderingar. Specificiteten är också hög i CRISPR / Cas-systemet.
Ladda ner PDF-versionen av CRISPR vs RNAi
Du kan ladda ner PDF-versionen av den här artikeln och använda den för offlineändamål enligt citat. Ladda ner PDF-version här Skillnaden mellan CRISPR och RNAi
