Huvudskillnaden mellan DMSO och MSM är att DMSO är en organosvavelförening som finns i den flytande fasen, medan MSM är en organosvavelförening som finns i den fasta fasen.
Uttrycket DMSO står för dimetylsulfoxid medan termen MSM står för metylsulfonylmetan. Båda dessa är organiska svavelföreningar. Det betyder; dessa föreningar har svavelatomer bundna till organiska föreningar. Den största skillnaden mellan DMSO och MSM ligger i fasen av materia där dessa föreningar finns vid rumstemperatur. Det finns också några andra skillnader utöver denna viktiga skillnad.