Huvudskillnaden mellan miceller och chylomikroner är att miceller är kulor av lipidmolekyler som är ordnade i en sfärisk form i en vattenlösning medan chylomikroner är lipoproteiner som består av en kärna tillverkad av triglycerider och kolesteroler och en kappa gjord av fosfolipider och apolipoproteiner.
Lipider är hydrofoba molekyler som är opolära och vattenolösliga. De bildar fettkulor i vatten. Miceller och chylomikroner är två typer av fettkulor. De är sfäriska i form. Miceller är sfäriska aggregat av lipidmolekyler i en vattenlösning. Chylomikroner är en typ av lipoproteiner som består av triglycerider, kolesteroler, fosfolipider, proteiner och apolipoproteiner. De transporterar kostfetter från tarmen till andra vävnader i kroppen.