Huvudskillnaden mellan mastigomycotina och zygomycota är att mastigomycotina är en polyfyletisk grupp av svampar som producerar flagellerade celler och har rhizoids medan zygomycota är en uppdelning av svampar som producerar karakteristiska resistenta sfäriska sporer som kallas zygospores under sexuell reproduktion.
Svampar är filamentösa eukaryota organismer som tillhör Kingdom Fungi. De producerar både sexuella och asexuella sporer. De kan vara saprofyter eller parasiter. Det finns olika typer av svampgrupper. Huvudgrupperna är mastigomycotina, zygomycota, ascomycota, basidiomycota och deuteromycota. Mastigomycotina består av zoosporiska svampar där många endast är vattenlevande. Zygomycota-svampar är konjugativa svampar som producerar karakteristiska zygosporer. Ascomycota-svampar är säcksvampar som producerar en säckliknande struktur som kallas ascus. Basidiomycota-svampar producerar en klubbformad struktur som kallas basidium. Deuteromycota-svampar är fungi imperfecti, vilket betyder att de bara har asexuellt eller myceliellt tillstånd.
