Nyckelskillnaden mellan UTR och intron är att UTR är en icke-kodande nukleotidsekvens som ingår i den mogna mRNA-sekvensen medan intron är en sekvens som inte ingår i den mogna mRNA-molekylen.
UTR eller otranslaterad region är en icke-kodande sekvens som finns i mRNA-molekylen. På varje sida av mRNA-sekvensen kan vi se en UTR. Därför finns det två UTR: er som 5'UTR och 3'UTR. Däremot är en intron en icke-kodande sekvens som finns mellan exoner av genen. Introner splitsas när man gör mRNA. Därför ses inte introner i mRNA-sekvensen. Men både UTR och intron är viktiga element i eukaryota genom.
