Huvudskillnaden mellan kromosombandning och kromosommålning är att kromosombandning är en färgningsteknik som visar kromosomområden i urskiljbara mörka och ljusa band, men kromosommålning är en hybridiseringsteknik där specifika regioner eller segment av kromosomer är målade med sekvensspecifika fluorescerande märkta sönder.
I cytogenetik är det nödvändigt att producera en synlig karyotyp av en organism för att identifiera kromosomer och deras avvikelser. Kromosombandning och kromosommålning är två cytogenetiska tekniker som hjälper till att visualisera kromosomer. Båda teknikerna är användbara för att identifiera genetiska störningar.
