Huvudskillnaden mellan epistasis och pleiotropi är att epistasis är fenomenet där en gen på ett ställe förändrar det fenotypiska uttrycket av en gen vid ett annat ställe medan pleiotropi förklarar fenomenet där en enda gen påverkar flera fenotypiska egenskaper.
Epistas och pleiotropi är två fenomen i genetiken. Epistasis inträffar när mer än en gen bestämmer en enda fenotyp. Därför påverkar en gen i epistasis uttrycket av en annan gen som ligger på ett annat ställe. Däremot uppstår pleiotropi när en gen bestämmer flera fenotyper. Därför bidrar en gen till flera egenskaper. Både epistas och pleiotropi är variationer av Mendelian Arv.
