Nyckelskillnad - VNTR vs STR
DNA-studier har enorm nytta för att förstå och bestämma fylogenetiska förhållanden, diagnostisera genetiska sjukdomar och kartlägga organismernas genom. Flera tekniker associerade med DNA-analys används för identifiering av en viss gen eller en DNA-sekvens i en pool av okänt DNA. De är kända som genetiska markörer. Genetiska markörer används i molekylärbiologi för att identifiera genetisk variation mellan individer och arter. Variabelt antal tandemupprepning (VNTR) och kort tandemupprepning (STR) är två typer av genetiska markörer som visar polymorfism hos individer. Båda typerna är icke-kodande repetitivt DNA som är tandemupprepningar. De är ordnade på ett sätt mot svans i kromosomer. VNTR är en sektion av genomet där kort nukleotidsekvens upprepas flera gånger. STR är en annan sektion av DNA inom genomet som är organiserad som upprepande enheter bestående av två till tretton nukleotider i hundra gånger. Nyckeldifferensen mellan VNTR och STR är antalet nukleotider i en upprepande sekvens. Upprepande enheter av VNTR består av 10 till 100 nukleotider medan upprepande enheter av STR består av 2 till 13 nukleotider. VNTR och STR används i stor utsträckning i kriminaltekniska studier.
INNEHÅLL
1. Översikt och nyckeldifferens
2. Vad är VNTR
3. Vad är STR
4. Likheter mellan VNTR och STR
5. Jämförelse sida vid sida - VNTR vs STR i tabellform
6. Sammanfattning
Vad är VNTR?
En tandemupprepning är en kort DNA-sekvens som upprepas från huvud till svans på ett specifikt kromosomalt lokus. Det finns ingen annan sekvens eller nukleotid inom tandemupprepningen. Det finns flera typer av tandemupprepningar i genomet. VNTR är en typ av tandemupprepning bland dem som har upprepande enheter bestående av 10 till 100 nukleotider. VNTR är en typ av minisatellit. Dessa tandemupprepningar finns i många kromosomer. De är blandade i det mänskliga genomet och ligger övervägande i de subtelomera regionerna i kromosomer.
VNTR visar tandem upprepad polymorfism bland individer. Längden på VNTR på en viss plats för kromosomen är mycket varierande bland individer på grund av variationen i antalet upprepade enheter organiserade i det DNA-avsnittet. Därför kan VNTR användas som ett kraftfullt verktyg för identifiering av individer och VNTR-analys används inom många områden inklusive genetik, biologiforskning, kriminalteknik och DNA-fingerutskrift. VNTR var de första genetiska markörerna som användes för att kvantifiera implantering av benmärgstransplantation. VNTR var också de första polymorfa markörerna som användes vid DNA-profilering i kriminalteknik.
Figur 01: Variation av VNTR i sex individer
VNTR-analys utförs via polymorfism med restriktionsfragmentlängd följt av sydlig hybridisering. Därför behöver det jämförelsevis ett stort DNA-prov. Tolkningen av VNTR-profilen är också problematisk. På grund av dessa begränsningar har användningen av VNTR inom rättsmedicinsk genetik varit begränsad och den ersätts av STR-analys.
Vad är STR?
STR är en mycket upprepad DNA-sektion som består av två till tretton nukleotidupprepande enheter organiserade på ett tandem sätt. STR liknar VNTR. Men det varierar från VNTR från antalet nukleotider i en upprepande sekvens och antalet upprepningar. STR är en typ av mikrosatellit.
STR-analys involverad i att mäta det exakta antalet upprepade enheter. STR är mycket varierande bland individer, liknar VNT. STR-profiler skiljer sig från person till person. Därför används STR-analys i molekylärbiologi för att jämföra specifika loci på DNA från två eller flera prover. Därför betraktas STR som kraftfulla genetiska markörer i molekylärbiologi. Det ger ett utmärkt verktyg för identifiering av individer på grund av deras höga grad av polymorfism och relativt kort längd.
För närvarande är STRs det mest använda analyserade genetiska polymorfismverktyget inom rättsmedicinsk genetik. De flesta kriminaltekniska ärenden involverar polymorf analys av STR. STR loci sprids över genomet. Det finns tusentals STRs i kromosomer som kan användas i kriminalteknisk analys. STR-analys involverar inte restriktionslängdspolymorfism som VNTR-analys. STR-analys skär inte DNA med restriktionsenzymer. Specifika sonder används för att fästa önskade regioner på DNA och med hjälp av PCR-teknik bestäms STR-längderna.
Figur 02: STR-variation mellan prover
Vad är likheterna mellan VNTR och STR?
- VNTR och STR är icke-kodande DNA.
- Båda är tandemupprepningar.
- Båda visar polymorfism bland individer på grund av skillnaden i längd på DNA-sektionen.
- Båda används som kraftfulla genetiska markörer vid DNA-fingeravtryck och i kriminaltekniska studier.
Vad är skillnaden mellan VNTR och STR?
Skilja artikeln mitt före bordet
VNTR vs STR |
|
| VNTR är ett icke-kodande repetitivt DNA som har en kort nukleotidsekvens som upprepas på ett tandem sätt. | STR är en mycket upprepad DNA-sektion som består av två till tretton nukleotidupprepande enheter organiserade på ett tandem sätt. |
| Storlek | |
| VNTR är större än STR. | STR är mindre än VNTR. |
| Antal nukleotider i upprepad sekvens | |
| Den upprepande enheten av VNTR består av 10 till 100 nukleotider. | Den upprepande enheten av STR består av 2 till 13 nukleotider. |
Sammanfattning - VNTR vs STR
VNTR och STR är två kraftfulla genetiska markörer som används i molekylärbiologi, särskilt inom rättsmedicinsk genetik. VNTR är en typ av minisatellit och STR är en mikrosatellit. VNTR och STR är icke-kodande, mycket repetitivt DNA. De är tandemupprepningar. Den allmänna strukturen för VNTR och STR är densamma. Antalet nukleotider i den upprepade sekvensen och längden är dock olika. VNTR har upprepade sekvenser består av 10 till 100 nukleotider. STR har upprepande sekvenser bestående av 2 till 13 nukleotider. Detta är skillnaden mellan VNTR och STR.
Ladda ner PDF-version av VNTR vs STR
Du kan ladda ner PDF-versionen av den här artikeln och använda den för offlineändamål enligt citat. Ladda ner PDF-versionen här Skillnaden mellan VNTR och STR.
