Nyckelskillnaden mellan iso- och neostrukturer är att prefixet iso avser en organisk förening som innehåller alla kolatomer utom en som bildar en kontinuerlig kedja medan prefixet neo avser en organisk förening som innehåller alla kolatomer utom två som bildar en kontinuerlig kedja.
Vi använder prefix i organisk kemi för att skilja en organisk molekyl från en annan. Vi använder dessa prefix tillsammans med namnet på föreningen. Eftersom dessa prefix är specifika för olika funktionella grupper i organiska molekyler, kan vi enkelt identifiera organiska molekyler även om de har nära besläktade kemiska strukturer.