Huvudskillnaden mellan hydrofoba och hydrofila aminosyror är att de hydrofoba aminosyrorna är opolära medan de hydrofila aminosyrorna är polära.
Aminosyror är byggstenarna i proteiner. Ett protein är en jätte polymermolekyl som är en väsentlig komponent i alla levande organismer. Vidare finns aminosyror huvudsakligen i två typer som essentiella och icke-viktiga aminosyror. Dessutom kan vi kategorisera dem som hydrofila och hydrofoba aminosyror, beroende på deras fysikalisk-kemiska natur. De skiljer sig från varandra, främst baserat på polariteten.