Huvudskillnaden mellan somatisk variation och germinal variation är att somatisk variation är den genetiska variationen som förekommer i somatiska celler medan germinal variation är den genetiska variationen som förekommer i könsceller som ägg eller spermier.
Genetisk variation avser processen att ändra det genetiska materialet i en organism eller skillnaden i DNA-sekvenser mellan individer inom en befolkning. DNA-sekvenser kan förändras med tiden i en generation till generation. Genetisk rekombination är en av de viktigaste mekanismerna som orsakar genetisk variation. Dessutom kan mutation också orsaka genetisk variation. Genetiskt har multicellulära organismer två huvudtyper av celler; somatiska celler och könsceller. Därför är genetisk variation av två typer; de är den somatiska variationen och den germinala variationen. Om den genetiska variationen förekommer i somatiska celler kallar vi det en somatisk variation, och om den genetiska variationen förekommer i könscellerna kallar vi det germinal variation. Somatiska variationer är mestadels icke-ärftliga medan germinala variationer mestadels ärftliga.