Huvudskillnaden mellan ammoniak och ammonium är att ammoniak är en oladdad polär molekyl som existerar som en gas vid rumstemperatur, medan ammoniumjoner laddas och existerar som fria joner i lösning eller som kristalliserade saltföreningar.
Det finns få bilder och till och med vissa dofter som våra sinnen omedelbart associerar med ammoniak eller ammonium; dessa inkluderar gödselmedel, kväveavfall, tvålar och till och med sprängämnen. Dessutom antar de flesta att det inte finns någon skillnad mellan ammoniak och ammonium. Den höga likheten mellan dessa två och användningen av ordet ammoniak oftare som en allmän term för både ren ammoniak och ammoniumföreningar är det som orsakar denna förvirring.