Nyckelskillnaden mellan grundareeffekt och genetisk drift är att en grundareeffekt är en händelse av genetisk drift där en liten grupp delar sig från huvudpopulationen för att etablera en koloni medan genetisk drift refererar till slumpmässiga förändringar av allelfrekvenser i små populationer som orsakar försvinnandet av vissa gener med tiden.
Evolution är den process som förklarar förändringen av egenskaper hos organismer under på varandra följande generationer. Evolution bygger på naturligt selektion och genetisk drift. På grund av naturligt urval förblir gynnsamma egenskaper i populationerna medan ogynnsamma egenskaper minskar från befolkningen över tiden. På liknande sätt orsakar genetisk drift slumpmässiga förändringar i allelfrekvenser i små populationer på grund av att vissa gener riskerar att försvinna på grund av att de dör eller undviker reproduktion. Grundareeffekt och flaskhalseffekt är två händelser av genetisk drift.