Huvudskillnaden mellan grundareeffekt och flaskhalseffekt är att grundareeffekten uppstår när en liten grupp i en befolkning splittras från den ursprungliga befolkningen och bildar en ny, medan flaskhalseffekten uppstår när befolkningen minskar betydligt till en mindre storlek på grund av naturkatastrofer som jordbävningar, översvämningar och bränder.
Genetisk drift är ett fenomen som är mycket mer sannolikt att förekomma i små populationer och mer sannolikt att förekomma i stora populationer. I grund och botten sker det på grund av slumpmässiga förändringar i allelfrekvenser, vilket kan leda till att vissa gener försvinner från små populationer. I slutändan orsakar genetisk drift mindre genetisk mångfald och variation i populationer. det orsakar också att vissa genvarianter försvinner helt från populationerna. Dessutom kan det orsaka att vissa sällsynta alleler blir vanligare än tidigare och till och med fixas. Det finns två typer av genetisk drift som flaskhalseffekt och grundareeffekt. De orsakar extrema minskningar av befolkningen.
