Huvudskillnaden mellan molekylär dockning och poängsättning är att dockning är en teknik som används för att bestämma bindningsaffiniteten mellan två molekyler medan poängsättning är en process för att utvärdera en viss pose genom att räkna antalet gynnsamma intermolekylära interaktioner.
Termerna molekylär dockning och poängsättning används inom molekylär modellering. Molekylär modellering är en teknik som används för att bestämma de möjliga arrangemangen för olika molekyler i en given substans. Denna teknik är viktig för att skapa nya stabila föreningar.
