Nyckelskillnaden mellan molekylär orbitalteori och valensbindningsteori är att molekylär orbitalteori beskriver molekylär orbitalbildning, medan valensbindningsteori beskriver atomorbitaler.
Olika molekyler har olika kemiska och fysiska egenskaper än enskilda atomer som förenades för att bilda dessa molekyler. För att förstå dessa skillnader mellan atom- och molekylära egenskaper är det nödvändigt att förstå den kemiska bindningsbildningen mellan flera atomer för att skapa en molekyl. För närvarande använder vi två kvantmekaniska teorier för att beskriva den kovalenta bindningen och den elektroniska strukturen hos molekyler. Dessa är valensbindningsteori och molekylär orbitalteori.
