Nyckelskillnaden mellan Klenow-fragment och DNA-polymeras 1 är att Klenow-fragmentet är en stor del av DNA-polymeras 1 som saknar 5 'till 3' exonukleasaktivitet medan DNA-polymeras är ett enzym av E. coli som har alla tre domänerna inklusive 5 'till 3 'exonukleasaktivitet.
DNA-polymeras är ett av de viktigaste enzymerna som är involverade i DNA-replikering i levande organismer. Det finns olika former av DNA-polymerasenzym som finns i eukaryoter och prokaryoter baserat på storlek och form. DNA-polymeras 1, 2 och 3 finns endast i prokaryota organismer och de spelar olika roller i DNA-replikering. DNA-polymeras 1 har tre domäner med 5 'till 3' polymeras, 3 'till 5' exonukleasaktivitet och 5 'till 3' exonukleasaktivitet. Klenow-fragmentet är en proteolytisk produkt av DNA-polymeras 1. Det har 5 till 3 'polymeras och 3' till 5 'exonukleasaktiviteter av intakt DNA-polymeras 1, men det saknar 5' till 3 'exonukleasaktivitet.