Transposon vs Retrotransposon
Transposoner och retrotransposoner är genetiska komponenter i DNA, och det finns stora skillnader mellan dem. Den procentuella närvaron av dessa genetiska material varierar mellan olika arter, och deras funktioner bestämmer organismens öden med mutationer och andra fenotypiskt viktiga förändringar. Transposoner och retrotransposoner är gener eller samlingar av vissa gener som ligger i DNA-strängarna, och förändringar av deras platser har varit huvudorsakerna till dessa konsekvenser. Denna artikel avser dock att diskutera funktionerna hos dessa gener kort och presenterar en jämförelse mellan transposoner och retrotransposoner.
Vad är Transposon?
Transposoner är intressanta fragment eller segment av DNA med förmågan att ändra placeringen av DNA-strängen i form av klipp-och-klistra-mekanism. På grund av transposonernas rörliga natur är dessa kända som hoppande gener. Transposoner är av två huvudtyper som kallas Transposoner av klass I och klass II Transposoner. Vanligtvis kallas klass II-typen som transposoner och klass I-typen kallas retrotransposoner. Processerna för skärning och klistrning av mobila DNA-segment regleras av enzymtransposasen. Enzymet binder till transposonets båda ändar och skär DNA-strängens fosfodiesterbindningar, isolerar transposonet, flyttar det till målstället och binder på det nya stället. Denna process är dock intressant att förstå,eftersom vissa transposoner bara kan flytta till vissa platser endast på grund av inkompatibiliteten hos bassekvenser med målplatsen. Gener med ena änden av en enda sträng har samma bassekvens med den andra änden av den andra enda strängen är transposoner med klibbiga kanter, eftersom de kan binda till platserna för mål-DNA-strängen med samma bassekvens som i de klibbiga ändarna. Denna rörlighet hos gener kan emellertid orsaka förändringar av genotypen liksom i fenotypen hos organismen. Forskare uppfann om transposoner och genetiskt modifierad mat och organismer enligt de föredragna anpassningarna gjordes sedan tillgängliga. Mycket produktiva jordbruksgrödor, antibiotika med medicinska egenskaper,husdjur var några av de fördelaktigt utvecklade produkterna efter uppfinningen av transposons av Barbara McClintock på 1940-talet.
Vad är Retrotransposon?
Retrotransposoner är transposoner av klass I, och dessa rör sig genom genomet genom mekanismen för kopiering och klistra. Mekanismen för rörligheten för retrotransposoner involverar få huvudsteg såsom kopiering av gensegmentet av DNA-strängen till RNA, överföring av kopian av RNA till målstället, transkription av RNA-sekvensen tillbaka till DNA med användning av omvänt transkriptas och insättning av genen i den nya platsen för DNA-sträng av genomet. De två ändarna av dessa retrotransposoner har vanligtvis långa terminalupprepningar med cirka 1000 baspar, och de används som identifieringsfunktioner för dessa gener. Dessa gener amplifieras lätt inuti genomet, och andelen retrotransposoner i det humana genomet är cirka 50%. Dessa kan vara ganska farliga eftersom det orsakande viruset mot AIDS, HIV,och T-cell leukemivirus har retrotransposoner i deras RNA-genom. I själva verket kan dessa virus binda retrotransposonerna till vilken plats som helst i de mänskliga DNA-strängarna med användning av omvänt transkriptas och integras. Integrasenzymet fungerar på samma sätt som transposas i klass II-transposoner.
Vad är skillnaden mellan Transposon och Retrotransposon?
• Transposoner är klass II-hoppande gener medan retrotransposoner faller i kategori klass I.
• Transposoner fungerar med transposasenzymet medan retrotransposoner fungerar med användning av två huvudenzymer som kallas omvänt transkriptas och integras.
• Terminaländarna är mycket längre i retrotransposoner än i transposons.
• Transposoner klipps från ursprunget och klistras in på målet; omvänt, att retrotransposoner kopieras från ursprunget till RNA och transkriberas vid målet.
• Förflyttningen av retrotransposoner involverar RNA men inte i transposoner.
