Huvudskillnaden mellan genetisk karta och fysisk karta ligger i de tekniker som används vid genommappning. När man genererar en genetisk karta används genetiska markörer och genetiska loci för att studera genlänkningsmönstren, medan fysisk kartläggning använder molekylärbiologiska tekniker såsom restriktionsfragmentlängd polymorfism (RFLP) och hybridiseringstekniker.
Genetiska kartor och fysiska kartor två typer av kartor som konstruerar för att visa generna i kromosomer. De involverar i genetisk diagnostik och för att förutsäga evolution angående genomanalys. Dessutom använder de för att analysera avstånden mellan gen loci och för att analysera genpolymorfismer.
