Huvudskillnaden mellan genetisk karta och kopplingskarta är den typ av gener som används för kartläggningsprocessen. Genetisk karta består av alla gener som finns på en viss kromosom medan kopplingskartan består av länkade gener som finns på en viss kromosom.
Genetisk karta och kopplingskarta är två typer av kromosomala kartor som illustrerar gener som finns på kromosomerna. En genetisk karta visar alla gener medan en kopplingskarta bara visar de länkade generna. Båda är mycket användbara vid diagnos av genetiska sjukdomar och störningar. Dessutom kan kromosomavvikelser detekteras med genetiska kartor och kopplingskartor. Länkningskartor ger vidare en uppfattning om utvecklingen av vissa gener.
