Nyckelskillnaden mellan klassisk och modern genetik är att den klassiska genetiken är den mendeliska genetiken eller det äldre genetikbegreppet, som enbart uttrycktes baserat på fenotyperna som härrör från avelförsök medan modern genetik är det nya begreppet genetik, vilket möjliggör direkt undersökning av genotyper tillsammans med fenotyper.
Den stora forskaren Gregor Mendel är far till genetik. Mendel introducerade flera lagar angående arv av egenskaper och hur egenskaperna övergår från förälder till avkomma. Således blev hans resultat grunden för det helt nya konceptet som upptäcktes senare i genetiken. Därför är klassisk genetik och modern genetik två olika begrepp. Klassisk genetik är dock grunden för modern genetik.
