Huvudskillnaden mellan endotel och mesotel är att endotel är det enkla skivepitelcellskiktet som täcker hela cirkulationssystemet inklusive blodkärl, lymfkärl och hjärtat medan mesotel är det enkla skivepitelcellskiktet som sträcker stora kroppshåligheter såsom bukhinnan, pleura och hjärtsäcken.
Epitel, mesotel och endotel är tre typer av cellskikt som täcker våra inre organ, kroppshåligheter och huden. Därför är de alla skyddande barriärer för kroppen. Strukturellt är mesotel och endotel specialiserade eller modifierade epitelskikt med mesodermalt ursprung. Följaktligen består de av enkla skivepitelceller. Både mesotel och endotel är enkelskiktade vävnader. De fodrar vissa inre ytor.
