Nyckelskillnaden mellan heterokromatin och eukromatin är att heterokromatin är den högt packade formen av kromatin som i allmänhet är inaktiv medan eukromatin är den löst packade formen av kromatin som i allmänhet är aktiv.
Kromatin är strukturen som håller DNA-strängen i en kromosom. Heterokromatin och eukromatin är de två huvudtyperna av kromatin som finns i cellerna. Det finns en skillnad mellan heterokromatin och eukromatin när det gäller struktur och funktion. Dessutom skiljer de sig också från transkriptions- och replikationsegenskaperna.
