Nyckelskillnaden mellan cis-cyklohexan och transcyklohexan är att cis-cyklohexan har sina substituenter som pekar på samma plan av ringen medan trans-cyklohexan har dess substituenter som pekar mot motsatta plan.
Cyklohexan är en cykloalkan i vilken en sexledad kolring som finns i stolkonformationen. I stolkonformationen har denna förening den lägsta vinkeltöjningen; sålunda är det mer stabilt än andra möjliga konformationer. Dessutom, i denna konformation, är hälften av väteatomerna anslutna till kolatomer i ringen. Vi kallar detta som ekvatoriell positionering. Den andra halvan är placerad vinkelrätt mot ringen. Vi kallar detta axiell positionering. När det finns två eller flera substituenter i cyklohexan kan vi observera cis och trans-isomerism genom att observera om substituenterna är i ekvatorial eller axiell position.
