Huvudskillnaden mellan mödrarnas och faderns DNA-testning beror på vilken typ av DNA-källa som används i testförfarandet. Maternal DNA-testning använder mitokondriellt DNA för att erhålla moderns anor, medan faderns DNA-test använder Y-DNA för att erhålla faderns härkomst.
Bestämning av anor hos både män och kvinnor är viktigt för att bestämma familjerelationer. Dessutom bestämmer moderns och faderns DNA-test också individernas identitet. Några av de molekylära tekniker som används i denna analys är DNA-fingeravtryck, kort tandemupprepningsanalys och restriktionsfragmentlängspolymorfism (RFLP).