Huvudskillnaden mellan septat- och aseptathyfer är att septathyfer har septa eller tvärväggar som delar hyfer i distinkta celler medan aseptathyfer saknar septa.
Hyfer är långa trådar eller trådliknande strukturer av svampar. Hyfer representerar den vegetativa strukturen hos svampar. Mycelium är samlingen av hyfer av en svamp. Svamphyfer består av celler omgivna av en cellvägg gjord av kitin. För att separera celler i hyferna finns det perforerade tvärväggar som kallas septa. Men septa finns inte i hyfer av alla svampar. Därför, baserat på närvaron och frånvaron av septa, har hyfer två typer: septathyfer och aseptathyfer.