Nyckelskillnaden mellan tyst och neutral mutation är att tyst mutation är en specifik typ av neutral mutation som inte har någon observerbar effekt på organismens fenotyp medan neutral mutation är en förändring i DNA-sekvensen som varken är fördelaktig eller skadlig för förmågan hos en organism att överleva och reproducera.
En mutation är en förändring som sker i DNA-nukleotidsekvensen. Mutation kan äga rum på grund av miljöfaktorer som cigarettrök och UV-ljus eller på grund av virala attacker, starka kemikalier etc. Mutationer i bakteriecellerna passerar in i nästa generationer medan mutationer i icke-bakteriecellerna (somatiska mutationer) inte passerar nästa generationer, och de kommer att påverka en enda organisms överlevnad. Tyst mutationer resulterar inte i förändringar i aminosyrasekvensen för det kodade proteinet. Neutrala mutationer orsakar inte någon observerbar effekt på organismens fenotyp.
